בעונה השנייה, עברו 4 שנים, מאז ששמונת הדיג'יגורלים הביסו את הרוע והצילו את שני העולמות, אך כעת יש בעיות בעולם הדיגיטלי, והדיג'יגורלים הישנים-טיקיי וקארי והדיג'יגורלים חדשים-דיוויס מוטומיה, יולי אינואי, קודי הידא וקן איצ'ייוצ'י (שבהתחלה היה הרשע בסיפור) יוצאים להציל את העולם מחדש.