3. מעלה נוספת מיוחדת וייחודית המאפיינת את מהדורת משניות וילנא החדש מעשרות שכלולים קטנים וגדולים, הדגשות בדיבור המתחיל, מראי מקומות בפונט אחר, ציורים חדשים שצוירו על ידי מומחים בעלי שם, לפי הוראות של תלמידי חכמים מופלגים שירדו לעומקם של דברים, שגם תיקנו מאות טעויות והמחישו את הדברים בצורה הבהירה ביותר.