ספר עין אי"ה הוא שער כניסה מופלא להכרת משנתו הרוחנית של הכהן הגדול מאחיו, הרב אברהם יצחק הכהן קוק זצ"ל. דברי חז"ל באגדה עוסקים בהיקף עצום של נושאים – למן הפרטיים ביותר ועד השאלות הלאומיות והא-לוהיות. באמצעותם מבקש הרב קוק להאיר את הדרך לעם שלם, שהתנתק מארצו קרוב לאלפיים שנה, ולאחר שחזר אליה מבקש לברר מחדש את היחס הנכון אל כל מה שהתנתק ממנו – העיסוק בלאום, הארץ, החול, העשייה האנושית, היחס לעולם הזה והנאותיו, אמון האדם בכוחותיו ובתכונותיו הטבעיות – וכל זאת מתוך חיבור עמוק לחיים של קדושה וטהרה.