הוא חיבר חמישה עשר ספרים בנגלה ובנסתר, שבעה מהם על התורה. למרבה הצער לא כל הספרים הגיעו לדפוס וכתבי היד נעלמו. בין ספריו: פירוש על הזוהר, חידושים על הרי"ף, הספר "מגלה עמוקות" שהודפס לאחר מותו והפך להיות ספר יסוד בקבלה. בספר ניתן למצוא רנ"ב (252) פירושים והסברים על תפילתו של משה, בפרשת ואתחנן שבספר דברים. ספר נוסף שחיבר ולא הגיע לדפוס הכיל 1,000 הסברים על האות א' הזעירא שבמילא 'ויקרא' שפותחת את חומש ויקרא. מכל כתב היד נותרו 83 הסברים בלבד והם נכללו בספרו "מגלה עמוקות" על התורה.
