אגדה עתיקה מספרת על חוסר איזון בין כוחות הטבע השונים באיי תפוז, דבר אשר יביא לאסון נורא. האגדה הופכת למציאות כאשר אספן פוקימונים בשם לורנס השלישי מתחיל את מסע האספנות שלו בתפיסת הציפורים האגדיות – ארטיקונו, זאפדוס ומולטרס, במטרה להעיר וללכוד את שומר הים האגדי – לוגיה. בינתיים, בזמן הזה, אש קטצ'אם, מיסטי וטרייסי מגיעים לאיזור האיים ולומדים מחבורה של תושבים מקומיים שתפקידו של אש הוא להציל את העולם. וכך, לאחר שהפוקימונים האגדיים נתפסים, סערה גדולה מתרחשת ולוגיה קם לחיים, אך הוא לא מצליח לגבור על שלושת הציפורים האגדיות לבדו. אש נרתם לעזרתו, ובעזרת הפוקימונים שלו ואמונה עצמית, הוא יוצא כנגד כל הסיכויים לאסוף את שלושת האוצרות מהאיים הסמוכים למקום אחד, דבר אשר מחזיר את השלום והשלווה לאיזור.